Los Fondos de Desarrollo Institucional(FDI), son adjudicados a través de concursos, que permitan financiar proyectos que tengan por objeto contribuir al desarrollo de las instituciones de educación superior y al mejoramiento de la calidad académica mediante las líneas de emprendimiento estudiantil y modernización de procesos.
 

Emprendimiento Estudiantil: Tiene por objeto apoyar iniciativas estudiantiles para su desarrollo integral. Dichas iniciativas deben ser elaboradas por estudiantes regulares de las instituciones participantes.

Modernización de Procesos: Tiene como propósito apoyar la reestructuración de aspectos organizacionales, físicos o procedimentales o la implementación de sistemas de apoyo a la gestión para elevar los rendimientos en el empleo de recursos y desarrollar el mejoramiento institucional.